MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis EAI5/NITR206

Total Repeats: 96669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021194	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494698362
2	NC_021194	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698362
3	NC_021194	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698362
4	NC_021194	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698362
5	NC_021194	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698362
6	NC_021194	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698362
7	NC_021194	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698362
8	NC_021194	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698362
9	NC_021194	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	494698362
10	NC_021194	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698362
11	NC_021194	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698362
12	NC_021194	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698362
13	NC_021194	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494698362
14	NC_021194	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	494698362
15	NC_021194	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698362
16	NC_021194	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	494698362
17	NC_021194	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	494698362
18	NC_021194	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	494698362
19	NC_021194	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494698362
20	NC_021194	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698362
21	NC_021194	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494698362
22	NC_021194	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494698362
23	NC_021194	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	494698362
24	NC_021194	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	494698362
25	NC_021194	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698362
26	NC_021194	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494698362
27	NC_021194	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698362
28	NC_021194	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698362
29	NC_021194	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	494698362
30	NC_021194	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698362
31	NC_021194	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698362
32	NC_021194	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	494698362
33	NC_021194	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494698362
34	NC_021194	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	494698363
35	NC_021194	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	494698363
36	NC_021194	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	494698363
37	NC_021194	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	494698363
38	NC_021194	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494698363
39	NC_021194	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698363
40	NC_021194	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494698363
41	NC_021194	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698363
42	NC_021194	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494698363
43	NC_021194	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	494698363
44	NC_021194	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	494698363
45	NC_021194	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698363
46	NC_021194	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698363
47	NC_021194	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698363
48	NC_021194	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698363
49	NC_021194	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698363
50	NC_021194	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698363
51	NC_021194	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	494698363
52	NC_021194	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698363
53	NC_021194	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494698363
54	NC_021194	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	494698363
55	NC_021194	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494698363
56	NC_021194	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	494698363
57	NC_021194	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494698363
58	NC_021194	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494698363
59	NC_021194	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	494698363
60	NC_021194	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	494698363
61	NC_021194	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698363
62	NC_021194	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	494698363
63	NC_021194	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	494698364
64	NC_021194	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494698364
65	NC_021194	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698364
66	NC_021194	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	494698364
67	NC_021194	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698364
68	NC_021194	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698364
69	NC_021194	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494698364
70	NC_021194	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494698364
71	NC_021194	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494698364
72	NC_021194	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	494698364
73	NC_021194	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698364
74	NC_021194	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494698364
75	NC_021194	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	494698364
76	NC_021194	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698364
77	NC_021194	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	494698364
78	NC_021194	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494698364
79	NC_021194	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698364
80	NC_021194	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698364
81	NC_021194	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698364
82	NC_021194	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698364
83	NC_021194	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698364
84	NC_021194	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698364
85	NC_021194	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494698364
86	NC_021194	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698364
87	NC_021194	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698364
88	NC_021194	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698364
89	NC_021194	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698364
90	NC_021194	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698364
91	NC_021194	GGT	2	6	4738	4743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698365
92	NC_021194	CCA	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494698365
93	NC_021194	ACG	2	6	4785	4790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698365
94	NC_021194	CGC	2	6	4870	4875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698365
95	NC_021194	CGG	2	6	4920	4925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698365
96	NC_021194	CG	3	6	4971	4976	0 %	0 %	50 %	50 %	494698365
97	NC_021194	AAG	2	6	5248	5253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494698366
98	NC_021194	GGT	2	6	5376	5381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698366
99	NC_021194	CGA	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698366
100	NC_021194	TGC	2	6	5435	5440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698366
101	NC_021194	CGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698366
102	NC_021194	CCAC	2	8	5492	5499	25 %	0 %	0 %	75 %	494698366
103	NC_021194	ACCG	2	8	5511	5518	25 %	0 %	25 %	50 %	494698366
104	NC_021194	GTG	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698366
105	NC_021194	CGG	2	6	5547	5552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698366
106	NC_021194	TGG	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698366
107	NC_021194	CGGCGT	2	12	5595	5606	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	494698366
108	NC_021194	GGT	2	6	5610	5615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698366
109	NC_021194	CAAG	2	8	5706	5713	50 %	0 %	25 %	25 %	494698366
110	NC_021194	AAG	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494698366
111	NC_021194	CGCC	2	8	5802	5809	0 %	0 %	25 %	75 %	494698366
112	NC_021194	CAA	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494698366
113	NC_021194	CGA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698366
114	NC_021194	GTC	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698366
115	NC_021194	TGG	2	6	6002	6007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698366
116	NC_021194	AGC	2	6	6049	6054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698366
117	NC_021194	GGC	2	6	6169	6174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698366
118	NC_021194	GC	3	6	6197	6202	0 %	0 %	50 %	50 %	494698366
119	NC_021194	GGT	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698366
120	NC_021194	AAGGAC	2	12	6247	6258	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	494698366
121	NC_021194	AGACCA	2	12	6341	6352	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	494698366
122	NC_021194	GCG	2	6	6513	6518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698366
123	NC_021194	CGGC	2	8	6617	6624	0 %	0 %	50 %	50 %	494698366
124	NC_021194	ATC	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494698366
125	NC_021194	GC	3	6	6703	6708	0 %	0 %	50 %	50 %	494698366
126	NC_021194	ATC	2	6	6745	6750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494698366
127	NC_021194	ACG	2	6	6773	6778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698366
128	NC_021194	TGT	2	6	6860	6865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494698366
129	NC_021194	GTT	3	9	6870	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494698366
130	NC_021194	CCG	2	6	6928	6933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698366
131	NC_021194	CTG	2	6	7000	7005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698366
132	NC_021194	GAA	2	6	7026	7031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494698366
133	NC_021194	CAA	2	6	7035	7040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494698366
134	NC_021194	ACC	2	6	7102	7107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494698366
135	NC_021194	GT	3	6	7124	7129	0 %	50 %	50 %	0 %	494698366
136	NC_021194	GAC	2	6	7147	7152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698366
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142	NC_021194	GAC	2	6	7319	7324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698367
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148	NC_021194	ACC	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494698367
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248	NC_021194	CTCA	2	8	12296	12303	25 %	25 %	0 %	50 %	494698372
249	NC_021194	ACG	2	6	12657	12662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698373
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255	NC_021194	C	6	6	13222	13227	0 %	0 %	0 %	100 %	494698374
256	NC_021194	GGC	2	6	13260	13265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698374
257	NC_021194	TCG	2	6	13280	13285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698374
258	NC_021194	AACC	2	8	13331	13338	50 %	0 %	0 %	50 %	494698374
259	NC_021194	GC	3	6	13382	13387	0 %	0 %	50 %	50 %	494698374
260	NC_021194	CCCG	2	8	13440	13447	0 %	0 %	25 %	75 %	494698374
261	NC_021194	TGC	2	6	13544	13549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698374
262	NC_021194	CAA	2	6	13728	13733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494698375
263	NC_021194	AAC	2	6	13879	13884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494698375
264	NC_021194	ACCTTC	2	12	13912	13923	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	494698375
265	NC_021194	TTC	2	6	13960	13965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494698375
266	NC_021194	GAC	2	6	14025	14030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698376
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268	NC_021194	GA	3	6	14119	14124	50 %	0 %	50 %	0 %	494698377
269	NC_021194	TGAT	2	8	14128	14135	25 %	50 %	25 %	0 %	494698377
270	NC_021194	GGCGT	2	10	14147	14156	0 %	20 %	60 %	20 %	494698377
271	NC_021194	TGCT	2	8	14175	14182	0 %	50 %	25 %	25 %	494698377
272	NC_021194	GCT	3	9	14189	14197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698377
273	NC_021194	GCC	2	6	14199	14204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698377
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276	NC_021194	ACC	2	6	14322	14327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494698377
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280	NC_021194	GGGCC	2	10	14430	14439	0 %	0 %	60 %	40 %	494698377
281	NC_021194	TGG	2	6	14440	14445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494698377
282	NC_021194	CG	3	6	14488	14493	0 %	0 %	50 %	50 %	494698377
283	NC_021194	CAT	2	6	14597	14602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494698377
284	NC_021194	TGC	2	6	14638	14643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698377
285	NC_021194	GCCC	2	8	14662	14669	0 %	0 %	25 %	75 %	494698377
286	NC_021194	CGC	2	6	14678	14683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698377
287	NC_021194	CGC	3	9	14693	14701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698377
288	NC_021194	GCT	2	6	14709	14714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698377
289	NC_021194	GAA	2	6	14781	14786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494698377
290	NC_021194	ACT	2	6	14863	14868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494698377
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292	NC_021194	ACC	2	6	15007	15012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494698378
293	NC_021194	GCC	2	6	15027	15032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494698378
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296	NC_021194	CA	3	6	15130	15135	50 %	0 %	0 %	50 %	494698378
297	NC_021194	GCGTT	2	10	15175	15184	0 %	40 %	40 %	20 %	494698378
298	NC_021194	CAG	2	6	15230	15235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698378
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301	NC_021194	GGGC	2	8	15443	15450	0 %	0 %	75 %	25 %	494698378
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303	NC_021194	GAC	2	6	15495	15500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494698378
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372	NC_021194	GC	3	6	18566	18571	0 %	0 %	50 %	50 %	494698381
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381	NC_021194	GCT	2	6	19065	19070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494698382
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383	NC_021194	GGTCC	2	10	19101	19110	0 %	20 %	40 %	40 %	494698382
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385	NC_021194	GCG	2	6	19235	19240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494698382
386	NC_021194	CG	4	8	19315	19322	0 %	0 %	50 %	50 %	494698382
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